蛋白質是由一串氨基酸摺疊而成的微型機器。其中真正負責「幹活」（比如咬住病毒、催化化學反應）的關鍵核心區域，叫做「基序」
過去 AI 的兩大痛點，題目又少又偏心：以前大家都只拿少數幾題、人工精心挑選過的基序來考 AI，根本看不出 AI 的真實全面實力。為了徹底解決上面兩個盲點，作者直接推出了兩套工具：
BILBY-PRO（超大規模的標準試卷庫）：
不再人工挑偏門題目，直接從權威資料庫（PROSITE）系統性撈出 174 類、共 220 道真實有功能的結構基序大考題，全面普查各家 AI。結果令 RFDiffusion 和 Proteina 變成「答題王」：能解開的題目最多、覆蓋率最高。
BILBY-MD（動態全原子模擬裁判）：
這就是前面提到的 BILBY-MD！它是一套「全原子分子動力學（MD）模擬考評框架」。
它不再只看靜態模型，而是把 AI 設計出來的蛋白質直接丟進模擬水溶液中「實測運轉一陣子」，看它在分子震盪動態下，那個關鍵基序是不是還能穩穩固定、結構會不會垮掉，用最嚴苛的動態標準給 AI 打分數。